IS3
Terminal inverted
repeat:
5’---TGAACTGCACCCCAAAAGTTAGACAGAAAAAATC
3’---TGTACTGACCCCAAAAAGTTAGACAAAAAATTTA
DR(target site duplication)
IR (inverted repeat)
orfA Tpase (Transposase)
orfB Tpase (Transposase)
TTGGTAA (orfA and orfB overlapping)
>SMu1720-SMu1719
TAATAAGGAGCTTATAACTAATATTTTATAAAAAGAAGAGGCTGGGTTTC
AAAAGTGAACTGCACCCCAAAAGTTAGACAGAAAAAATCTAACTTTTGGG
GTGTTTTTATT
ATGAAATTGACTTATGAAGATAAAGTTCTCATCTATGAACTGAAAAACCA
AGGGTATAGCTTAGAGCAGCTTTCAAATAAATTTGGGATAAAAATTTCTA
ATCTTAGCTACATGATTAAATTGATTGATCATTACGGAATAGAGATCGTC
AAAAAAGGAAAGAATCGTTACTATTCTCCTGAACTAAAACAAGAAATCAT
TGATAAAGTTCTTCTTGAAGGTCGTTCACAAATAAGGGTGTCTCTAGATT
ATGCTCTTCCAAGTCATGGAATGTTGCCTAATTGGATAGCACAATACAAG
AAAAATAGGTATACTATTGTTGAGAAAACAAGAGGGAGACCACCTAAAAT
GGGACGTAAGCCAAAGAAGAAATCGGAAGAAATGACAGAGCTAGAGCAAC
TTCAGAAAGAATTAGAATATCTGAGAGCGGAGAATGCTGTTCTAAAAAAG
TTGAGAGAACTCCGATTGAGGGAAGAAAAAGAGCAAGAAGAAAAACGGAA
ATTGTCCGAGGA
TTGGTAACGGAGTTTTCTTTAGACATTCTTCTAAAGATTATTAAGCTCGC
TCGTTCAACCTATTATTACCACTTAAAGCAGCTAGATAAAAGCAATAAAG
ATCATGCTATTAAAGCTGAAATTCAAGCTATTTTTACTGAGCACAAAGGA
AATTATGGTTATCGTCGAATGACTCTTGAATTGAGAAATCGTGGCTTCTT
GGTAAATCATAAAAAGGTTCAACGTCTAATGAAAGTTCTTGGTTTGGAGG
CTCGTATTCGTCGCAAACGGAAGTATTCTTCCTACCAAGGAGAGGTGGGC
AAGAAAGCAGACAACCTTATTCAACGCCAATTTGAAGCATCAAAACCAAT
GGAAAAGTGCTACACAGATGTGACAGAATTTGCCATTCCAGCAAGCGGTC
AAAAGCTCTATTTGTCACCAGTTTTAGATGGTTTCAACAGTGAAATTATT
GCTTATAACCTTTCTACGTCACCGAACTTGATACAAGTGAAAGCTATGCT
AGAACAGGCTTTCACAGAGAAACATTACACAAATACTATTCTTCATAGTG
ACCAAGGCTGGCAATACCAGCATGATTTTTATCATCAATTTTTAGAGAAC
AAGGGGATTCAGCCGTCCATGTCACGTAAAGGAAACAGCCCAGATAATGG
CATGATGGAATCTTTCTTTGGCATTTTGAAATCCGAAATGTTTTACGGTT
ATGAGAAGACATTTAAGTCACTTAAGCAATTGGAACAAGCTATTGTAGAC
TATATTGATTATTACAACAACAAACGTATTAAGGTAAAACTAAAAGGACT
TAGTCCTGTACAGTACAGAACGAAATCCTTTACT
TAAATTTTTTGTCTAACTTTTTGGGGTCAGTACAAAGTCCTGTCTCTTTT
TTTACAAAGGGTTACAATAAAATCATTAGCTAAAAAGGTTAATAAATCTA
ATTAAAGTGAGGTAAGTTTTTT
>SMu1284-SMu1283
TAGAAAGATACTTAAATAAAAGTTAAAAAAAGTCATTATATTGAACTGCA
CCCCAAAAGTTAGACAGAAAAAATCTAACTTTTGGGGTGTTTTTATT
ATGAAATTGACTTATGAAGATAAAGTTCTCATCTATGAACTGAAAAACCA
AGGGTATAGCTTAGAGCAGCTTTCAAATAAATTTGGGATAAAAATTTCTA
ATCTTAGCTACATGATTAAATTGATTGATCATTACGGAATAGAGATCGTC
AAAAAAGGAAAGAATCGTTACTATTCTCCTGAACTAAAACAAGAAATCAT
TGATAAAGTTCTTCTTGAAGGTCGTTCACAAATAAGGGTGTCTCTAGATT
ATGCTCTTCCAAGTCATGGAATGTTGCCTAATTGGATAGCACAATACAAG
AAAAATAGGTATACTATTGTTGAGAAAACAAGAGGGAGACCACCTAAAAT
GGGACGTAAGCCAAAGAAGAAATCGGAAGAAATGACAGAGCTAGAGCAAC
TTCAGAAAGAATTAGAATATCTGAGAGCGGAGAATGCTGTTCTAAAAAAG
TTGAGAGAACTCCGATTGAGGGAAGAAAAAGAGCAAGAAGAAAAACGGAA
ATTGTCCGAGGA
TTGGTAACGGAGTTTTCTTTAGACATTCTTCTAAAGATTATTAAGCTCGC
TCGTTCAACCTATTATTACCACTTAAAGCAGCTAGATAAAAGCAATAAAG
ATCATGCTATTAAAGCTGAAATTCAAGCTATTTTTACTGAGCACAAAGGA
AATTATGGTTATCGTCGAATGACTCTTGAATTGAGAAATCGTGGCTTCTT
GGTAAATCATAAAAAGGTTCAACGTCTAATGAAAGTTCTTGGTTTGGAGG
CTCGTATTCGTCGCAAACGGAAGTATTCTTCCTACCAAGGAGAGGTGGGC
AAGAAAGCAGACAACCTTATTCAACGCCAATTTGAAGCATCAAAACCAAT
GGAAAAGTGCTACACAGATGTGACAGAATTTGCCATTCCAGCAAGCGGTC
AAAAGCTCTATTTGTCACCAGTTTTAGATGGTTTCAACAGTGAAATTATT
GCTTATAACCTTTCTACGTCACCGAACTTGATACAAGTGAAAGCTATGCT
AGAACAGGCTTTCACAGAGAAACATTACACAAATACTATTCTTCATAGTG
ACCAAGGCTGGCAATACCAGCATGATTTTTATCATCAATTTTTAGAGAAC
AAGGGGATTCAGCCGTCCATGTCACGTAAAGGAAACAGCCCAGATAATGG
CATGATGGAATCTTTCTTTGGCATTTTGAAATCCGAAATGTTTTACGGTT
ATGAGAAGACATTTAAGTCACTTAAGCAATTGGAACAAGCTATTGTAGAC
TATATTGATTATTACAACAACAAACGTATTAAGGTAAAACTAAAAGGACT
TAGTCCTGTACAGTACAGAACGAAATCCTTTACT
TAAATTTTTTGTCTAACTTTTTGGGGTCAGTACATATAAGATATGACTTT
TTTTAATCGCAAGATGCATTTTTCTGTATAATAGAGATAGAATAATCAGA
AAAAGAAAGGAACTATCG
>SMu0694-SMu0695
TAAAACAAAGGACTTATTGAACTGCACCCCAAAAGTTAGACAGAAAAAAT
CTAACTTTTGGGGTGTTTTTATT
ATGAAATTGACTTATGAAGATAAAGTTCTCATCTATGAACTGAAAAACCA
AGGGTATAGCTTAGAGCAGCTTTCAAATAAATTTGGGATAAAAATTTCTA
ATCTTAGCTACATGATTAAATTGATTGATCATTACGGAATAGAGATCGTC
AAAAAAGGAAAGAATCGTTACTATTCTCCTGAACTAAAACAAGAAATCAT
TGATAAAGTTCTTCTTGAAGGTCGTTCACAAATAAGGGTGTCTCTAGATT
ATGCTCTTCCAAGTCATGGAATGTTGCCTAATTGGATAGCACAATACAAG
AAAAATAGGTATACTATTGTTGAGAAAACAAGAGGGAGACCACCTAAAAT
GGGACGTAAGCCAAAGAAGAAATCGGAAGAAATGACAGAGCTAGAGCAAC
TTCAGAAAGAATTAGAATATCTGAGAGCGGAGAATGCTGTTCTAAAAAAG
TTGAGAGAACTCCGATTGAGGGAAGAAAAAGAGCAAGAAGAAAAACGGAA
ATTGTCCGAGGA
TTGGTAACGGAGTTTTCTTTAGACATTCTTCTAAAGATTATTAAGCTCGC
TCGTTCAACCTATTATTACCACTTAAAGCAGCTAGATAAAAGCAATAAAG
ATCATGCTATTAAAGCTGAAATTCAAGCTATTTTTACTGAGCACAAAGGA
AATTATGGTTATCGTCGAATGACTCTTGAATTGAGAAATCGTGGCTTCTT
GGTAAATCATAAAAAGGTTCAACGTCTAATGAAAGTTCTTGGTTTGGAGG
CTCGTATTCGTCGCAAACGGAAGTATTCTTCCTACCAAGGAGAGGTGGGC
AAGAAAGCAGACAACCTTATTCAACGCCAATTTGAAGCATCAAAACCAAT
GGAAAAGTGCTACACAGATGTGACAGAATTTGCCATTCCAGCAAGCGGTC
AAAAGCTCTATTTGTCACCAGTTTTAGATGGTTTCAACAGTGAAATTATT
GCTTATAACCTTTCTACGTCACCGAACTTGATACAAGTGAAAGCTATGCT
AGAACAGGCTTTCACAGAGAAACATTACACAAATACTATTCTTCATAGTG
ACCAAGGCTGGCAATACCAGCATGATTTTTATCATCAATTTTTAGAGAAC
AAGGGGATTCAGCCGTCCATGTCACGTAAAGGAAACAGCCCAGATAATGG
CATGATGGAATCTTTCTTTGGCATTTTGAAATCCGAAATGTTTTACGGTT
ATGAGAAGACATTTAAGTCACTTAAGCAATTGGAACAAGCTATTGTAGAC
TATATTGATTATTACAACAACAAACGTATTAAGGTAAAACTAAAAGGACT
TAGTCCTGTACAGTACAGAACGAAATCCTTTACTTAA
TAAATTTTTTGTCTAACTTTTTGGGGTCAGTACATATTATCCTTTGTTTT
TA
>SMu0396-SMu0395
TAGTTTAAAAATAAGTCTAAATGACAAGCCGTTTTTGTCCTAATTTTTTA
TCAACTATTAAAAAAGGCTGGAATATCGTTCACAA
ATGAACTGCACCCCAAAAGTTAGACAGAAAAAATCTAACTTTTGGGGTGT
TTTTATTATGAAATTGACTTATGAAGATAAAGTTCTCATCTATGAACTGA
AAAACCAAGGGTATAGCTTAGAGCAGCTTTCAAATAAATTTGGGATAAAA
ATTTCTAATCTTAGCTACATGATTAAATTGATTGATCATTACGGAATAGA
GATCGTCAAAAAAGGAAAGAATCGTTACTATTCTCCTGAACTAAAACAAG
AAATCATTGATAAAGTTCTTCTTGAAGGTCGTTCACAAATAAGGGTGTCT
CTAGATTATGCTCTTCCAAGTCATGGAATGTTGCCTAATTGGATAGCACA
ATACAAGAAAAATAGGTATACTATTGTTGAGAAAACAAGAGGGAGACCAC
CTAAAATGGGACGTAAGCCAAAAAAGAAAATCGGAAGAAATGACAGAGCT
AGAGCAACTTCAGAAAGAATTAGAATATCTGAGAGCGGAGAATGCTGTTC
TAAAAAAGTTGAGAGAACTCCGATTGAGGGAAGAAAAAGAGCAAGAAGAA
AAACGGAAATTGTCCGAGGAT
TGGTAACGGAGTTTTCTTTAGACATTCTTCTAAAGATTATTAAGCTCGC
TCGTTCAACCTATTATTACCACTTAAAGCAGCTAGATAAAAGCAATAAAG
ATCATGCTATTAAAGCTGAAATTCAAGCTATTTTTACTGAGCACAAAGGA
AATTATGGTTATCGTCGAATGACTCTTGAATTGAGAAATCGTGGCTTCTT
GGTAAATCATAAAAAGGTTCAACGTCTAATGAAAGTTCTTGGTTTGGAGG
CTCGTATTCGTCGCAAACGGAAGTATTCTTCCTACCAAGGAGAGGTGGGC
AAGAAAGCAGACAACCTTATTCAACGCCAATTTGAAGCATCAAAACCAAT
GGAAAAGTGCTACACAGATGTGACAGAATTTGCCATTCCAGCAAGCGGTC
AAAAGCTCTATTTGTCACCAGTTTTAGATGGTTTCAACAGTGAAATTATT
GCTTATAACCTTTCTACGTCACCGAACTTGATACAAGTGAAAGCTATGCT
AGAACAGGCTTTCACAGAGAAACATTACACAAATACTATTCTTCATAGTG
ACCAAGGCTGGCAATACCAGCATGATTTTTATCATCAATTTTTAGAGAAC
AAGGGGATTCAGCCGTCCATGTCACGTAAAGGAAACAGCCCAGATAATGG
CATGATGGAATCTTTCTTTGGCATTTTGAAATCCGAAATGTTTTACGGTT
ATGAGAAGACATTTAAGTCACTTAAGCAATTGGAACAAGCTATTGTAGAC
TATATTGATTATTACAACAACAAACGTATTAAGGTAAAACTAAAAGGACT
TAGTCCTGTACAGTACAGAACGAAATCCTTTACT
TAAATTTTTTGTCTAACTTTTTGGGGTCAGTACAAAAACGACTTCCACGC
CTTTTTCTTTTTTATAATCATCTTTCTTTACTTGCCTTTA
>SMu1257-SMu1258
TAGCCAGTCCGACAAAAACTATTCCAACTTACTCCTACGCCACATTCAAG
ATATTTTTAATTTATTCTAAAGAAAATAAAAGAGAGCTTTTTCTGATTGC
TATGAACTGCACCCCAAAAGTTAGACAGAAAAAATCTAACTTTTGGGGTG
TTTTTATT
ATGAAATTGACTTATGAAGATAAAGTTCTCATCTATGAACTGAAAAACCA
AGGGTATAGCTTAGAGCAGCTTTCAAATAAATTTGGGATAAAAATTTCTA
ATCTTAGCTACATGATTAAATTGATTGATCATTACGGAATAGAGATCGTC
AAAAAAGGAAAGAATCGTTACTATTCTCCTGAACTAAAACAAGAAATCAT
TGATAAAGTTCTTCTTGAAGGTCGTTCACAAATAAGGGTGTCTCTAGATT
ATGCTCTTCCAAGTCATGGAATGTTGCCTAATTGGATAGCACAATACAAG
AAAAATAGGTATACTATTGTTGAGAAAACAAGAGGGAGACCACCTAAAAT
GGGACGTAAGCCAAAGAAGAAATCGGAAGAAATGACAGAGCTAGAGCAAC
TTCAGAAAGAATTAGAATATCTGAGAGCGGAGAATGCTGTTCTAAAAAAG
TTGAGAGAACTCCGATTGAGGGAAGAAAAAGAGCAAGAAGAAAAACGGAA
ATTGTCCGAGGA
TTGGTAACGGAGTTTTCTTTAGACATTCTTCTAAAGATTATTAAGCTCGCTCG
TTCAACCTATTATTACCACTTAAAGCAGCTAGATAAAAGCAATAAAGATC
ATGCTATTAAAGCTGAAATTCAAGCTATTTTTACTGAGCACAAAGGAAAT
TATGGTTATCGTCGAATGACTCTTGAATTGAGAAATCGTGGCTTCTTGGT
AAATCATAAAAAGGTTCAACGTCTAATGAAAGTTCTTGGTTTGGAGGCTC
GTATTCGTCGCAAACGGAAGTATTCTTCCTACCAAGGAGAGGTGGGCAAG
AAAGCAGACAACCTTATTCAACGCCAATTTGAAGCATCAAAACCAATGGA
AAAGTGCTACACAGATGTGACAGAATTTGCCATTCCAGCAAGCGGTCAAA
AGCTCTATTTGTCACCAGTTTTAGATGGTTTCAACAGTGAAATTATTGCT
TATAACCTTTCTACGTCACCGAACTTGATACAAGTGAAAGCTATGCTAGA
ACAGGCTTTCACAGAGAAACATTACACAAATACTATTCTTCATAGTGACC
AAGGCTGGCAATACCAGCATGATTTTTATCATCAATTTTTAGAGAACAAG
GGGATTCAGCCGTCCATGTCACGTAAAGGAAACAGCCCAGATAATGGCAT
GATGGAATCTTTCTTTGGCATTTTGAAATCCGAAATGTTTTACGGTTATG
AGAAGACATTTAAGTCACTTAAGCAATTGGAACAAGCTATTGTAGACTAT
ATTGATTATTACAACAACAAACGTATTAAGGTAAAACTAAAAGGACTTAG
TCCTGTACAGTACAGAACGAAATCCTTTACT
TAAATTTTTTGTCTAACTTTTTGGGGTCAGTACACTAAAGCATCATAAGG
CCTCTCTTATTTTTTTCTAGATAGCATATCTCATCACTCAATGATTGTTT
TATCTACTTTTTTA
>SMu0515-SMu0514
GAGTTACTCCTCTAAAATGATATGACATATTATATTACAATTTGAATAAA
AATACAAGTTACCTTTTAACAATTTACAAGAGCAAAAGCAGACAAACAAC
AAGTCCCCTAAAAACTATTATTTAATCAACAACACCAAAAATAAAGCTCT
TGTACTGAACTTTAAAAAGGAGTCCAGAACTGAACTGCACCCCAAAAGTT
AGACAGAAAAAATCTAACTTTTGGGGTGTTTTTATT
ATGAAATTGACTTATGAAGATAAAGTTCTCATCTATGAACTGAAAAACCA
AGGGTATAGCTTAGAGCAGCTTTCAAATAAATTTGGGATAAAAATTTCTA
ATCTTAGCTACATGATTAAATTGATTGATCATTACGGAATAGAGATCGTC
AAAAAAGGAAAGAATCGTTACTATTCTCCTGAACTAAAACAAGAAATCAT
TGATAAAGTTCTTCTTGAAGGTCGTTCACAAATAAGGGTGTCTCTAGATT
ATGCTCTTCCAAGTCATGGAATGTTGCCTAATTGGATAGCACAATACAAG
AAAAATAGGTATACTATTGTTGAGAAAACAAGAGGGAGACCACCTAAAAT
GGGACGTAAGCCAAAGAAGAAATCGGAAGAAATGACAGAGCTAGAGCAAC
TTCAGAAAGAATTAGAATATCTGAGAGCGGAGAATGCTGTTCTAAAAAAG
TTGAGAGAACTCCGATTGAGGGAAGAAAAAGAGCAAGAAGAAAAACGGAA
ATTGTCCGAGGA
TTGGTAACGGAGTTTTCTTTAGACATTCTTCTAAAGATTATTAAGCTCGCTCG
TTCAACCTATTATTACCACTTAAAGCAGCTAGATAAAAGCAATAAAGATC
ATGCTATTAAAGCTGAAATTCAAGCTATTTTTACTGAGCACAAAGGAAAT
TATGGTTATCGTCGAATGACTCTTGAATTGAGAAATCGTGGCTTCTTGGT
AAATCATAAAAAGGTTCAACGTCTAATGAAAGTTCTTGGTTTGGAGGCTC
GTATTCGTCGCAAACGGAAGTATTCTTCCTACCAAGGAGAGGTGGGCAAG
AAAGCAGACAACCTTATTCAACGCCAATTTGAAGCATCAAAACCAATGGA
AAAGTGCTACACAGATGTGACAGAATTTGCCATTCCAGCAAGCGGTCAAA
AGCTCTATTTGTCACCAGTTTTAGATGGTTTCAACAGTGAAATTATTGCT
TATAACCTTTCTACGTCACCGAACTTGATACAAGTGAAAGCTATGCTAGA
ACAGGCTTTCACAGAGAAACATTACACAAATACTATTCTTCATAGTGACC
AAAGCTGGCAATACCAGCATGATTTTTATCATCAATTTTTAGAGAACAAG
GGGATTCAGCCGTCCATGTCACGTAAAGGAAACAGCCCAGATAATGGCAT
GATGGAATCTTTCTTTGGCATTTTGAAATCCGAAATGTTTTACGGTTATG
AGAAGACATTTAAGTCACTTAAGCAATTGGAACAAGCTATTGTAGACTAT
ATTGATTATTACAACAACAAACGTATTAAGGTAAAACTAAAAGGACTTAG
TCCTGTACAGTACAGAACGAAATCCTTTACT
TAAATTTTTTGTCTAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTCTTTTGTTCCAG
ACCCCTTTTTTGAATAACTATTA